Mehmet Çelebi, Türk birliğini Anadolu’da yeniden tesis etme fikrindeydi. Bu hedef doğrultusunda en büyük rakibi Karamanoğlu Mehmet Bey’di.
Aralarında akrabalık bağları da bulunmaktaydı. Mehmet Çelebi’nin halasının oğlu olan Karamanoğlu Mehmet Bey, Fetret Devrinin getirdiği yönetim boşluğundan yararlanarak Osmanlı topraklarının bir kısmını ele geçirmişti. Bunun üzerine sefere çıkan Mehmet Çelebi, ilk olarak Aydınoğulları’ndan İzmir’i, ardından ise Karamanoğulları’ndan Akşehir, Beyşehir ve Seydişehir’i almayı başardı. Sonrasında Menteşeoğulları ve Tekeoğulları da Osmanlı’ya bağlılıklarını bildirdiler.
Saruhanoğulları Beyliği’ni ortadan kaldıran Mehmet Çelebi, Candaroğulları’ndan da Samsun’u aldı. Osmanlı Devleti böylece doğudaki Akkoyunlu ve Karakoyunlu Devletleriyle sınır komşusu oldu.
Mehmet Çelebi döneminde Anadolu’da yaşanan önemli olaylardan biri Şeyh Bedrettin İsyanı’ydı. Şeyh Bedrettin, Fetret Devrinin yarattığı karmaşadan faydalanarak kendi ideolojisini yayma çabasına girdi. Ancak Şeyh Bedrettin’in düşünceleri, Osmanlı Devleti’ndeki İslam anlayışına aykırıydı.
Müritlerinin İzmir ve Manisa’da çıkardığı ayaklanmalar sert bir şekilde bastırıldı. Ardından Rumeli’ye geçerek başlattığı isyan da bastırıldı. Şeyh Bedrettin sonunda yakalandı, yargılandı ve 1420’de idam edildi.
Mehmet Çelebi döneminde iç karışıklıklardan biri de kardeşi Mustafa Çelebi İsyanı’ydı. Mustafa Çelebi, Bizans İmparatorluğundan aldığı destek ile tahtı ele geçirmek amacıyla isyan etti.
Mehmet Çelebi, Rumeli’ye gelerek Mustafa Çelebi’yi mağlup etti. Bunun üzerine Mustafa Çelebi, Bizans’a sığındı. Mehmet Çelebi’nin vefatından sonra, II. Murat döneminde Bizans’ın kışkırtmasıyla tekrar isyan etti, ancak bu ayaklanma da II. Murat tarafından bastırıldı.
I. Murat’ın karşılaştığı diğer bir ayaklanma ise kardeşi Şehzade Mustafa İsyanı’ydı. II. Murat İstanbul’u kuşattığı sırada, Bizans Şehzade Mustafa’yı kışkırtarak isyan etmesine neden oldu.
İstanbul kuşatmasını kaldıran II. Murat, Şehzade Mustafa’yı yakalayarak isyana son verdi.